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ここでは全登場ゾイドが掲載されています。
| 初期機体 | |||
| 名前 | 種類 | 乗り換えアイテム | 特殊技 |
| ゴジュラス（GJ） | ２足 | クラッシャークロー | |
| アイアンコング（IK） | ２足 | ||
| シールドライガー（SL） | ４足 | ||
| セイバータイガー（ST） | ４足 | ||
| コマンドウルフ（CW） | ４足 | Ｅバイトファング | |
| レッドホーン（RH） | ４足 | ||
| ライガーゼロ（LZ） | ４足 | ||
| ジェノザウラー（GS） | ２足 | ||
| バーサークフューラー（BF） | ２足 | バスタークロー | |
| LZ フェニックス（PH） | ４足 | ＢＬＯＸ フェニックス | 滑空 |
| 乗り換え機体（要 准尉以上） | |||
| 名前 | 種類 | 乗り換えアイテム | 特殊技 |
| ゴジュラス ジ オーガ（GO） | ２足 | オーガノイドシステム | |
| アイアンコングＰＫ（PK） | ２足 | プロイツェン勲章 | |
| ブレードライガー（BL） | ４足 | ライガーブレード | ブレード展開 |
| ジェノブレイカー（GB） | ２足 | エクスブレイカー | |
| LZ シュナイダー（SC） | ４足 | ＣＡＳ 「シュナイダー」 | ブレード展開、セブンブレードアタック |
| LZ イエーガー（JA） | ４足 | ＣＡＳ 「イエーガー」 | ブーストアタック |
| LZ パンツァー（PA） | ４足 | ＣＡＳ 「パンツァー」 | バーニング・ビッグバン |
| ケーニッヒウルフ（KW） | ４足 | スコープ | スコープ展開 |
| ディバイソン（DB） | ４足 | １７連突撃砲 | メガロマックス |
| ＢＦ シュトゥルム（BS） | ２足 | ＣＡＳ 「シュトゥルム」 | |
| ダークスパイナー（DS） | ２足 | レアヘルツユニット | |
| LZ ファルコン（FA） | ４足 | ジェットファルコン | 滑空、ダイビングレーザークロー |
| レイズタイガー（RT） | ４足 | 古代虎 「蒼の核」 | |
| ブラストルタイガー（BT） | ４足 | 古代虎 「紅の核」 | サーミックバースト |
| バスターフューラー（BU） | ２足 | バスターイーグル | 滑空 |
| ムラサメライガー（ML） | ４足 | ムラサメブレード | ブレード展開 |
| 乗り換え機体（要 少佐以上） | |||
| 名前 | 種類 | 乗り換えアイテム | 特殊技 |
| ライトニングサイクス（LS） | ４足 | ＣＣＳシステム | |
| ゴジュラスギガ（GG） | ２足 | 封印武装３２門ＺＣ砲 | 封印武装ゾイドコアキャノン |
| LZ イクス（LX） | ４足 | ＣＡＳ 「イクス」 | ブレード展開 |
| マトリクスドラゴン（MD） | ２足 | Ｚｉソウル | 滑空 |
| ロードゲイル（LG） | ２足 | ＢＬＯＸ 「キメラ」 | 滑空、マグネイズサンダー |
| 凱龍輝（GA） | ２足 | 飛燕・月甲 | |
| ハヤテライガー（HL） | ４足 | エヴォルト「疾風」 | ブレード展開 |
| 乗り換え機体（要 准将以上） | |||
| 名前 | 種類 | 乗り換えアイテム | 特殊技 |
| エナジーライガー（EL） | ４足 | エナジーチャージャー | レシプロケイティングミサイル |
| ボスゾイド（搭乗不可能） | |||
| 名前 | 種類 | ステージ | 攻撃手段 |
| デススティンガー（DST） | ８足 | シドニア以外のステージ | 荷電粒子砲、AZ９３０ｍｍ２連装ショックガン、 AZ１２０ｍｍハイパービームガン、格闘、衝撃波 |
| デスザウラー（DS） | ２足 | 前作シドニア | 荷電粒子砲、AEZ２０ｍｍデスビームガン、 １６連ミサイルランチャー、衝撃波 |
| ウルトラザウルス（US） | ４足 | 前作シドニア | ４連型小型グラビティキャノン、AAZ９０ｍｍ３連装 パルスレーザー、８連装ミサイルランチャー、衝撃波 |
| セイスモサウルス（SS） | ４足 | 前作シドニア | 超収束荷電粒子砲（ゼネバス砲）、２連装ビームガン、 ４連対ゾイド３０ｍｍビーム砲、小口径レーザー機獣 |
| アイアンコング系についてはゴリラ自体がヒト科の動物なので、移動時は両手足を使っていますが、 ２足として分類します。 ※イエーガーの特殊技ブーストアタックは別名「ミラージュ・ファングクラッシュ」とも呼ばれていますが、正式名は ブーストアタックです。また、エナジーライガーの「ガード不能ウイング」についてはバグ技だと思われる技なので、 特殊技の欄には書きませんでした。ご了承ください。 ※LZ＝ライガーゼロ、BF＝バーサークフューラーの略称。※略称については他の略称の仕方もありますが、 標準的なものを載せてみました。 例 ゴジュラス・ジ・オーガ＝GO、GTO LZ ファルコン＝FA、ZF |
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