| バン・フライハイト |
| 性別/年齢 |
男 １４歳 |
| 身分 |
ゾイド乗り |
本作の主人公。父のような立派なゾイド乗りになることを夢見る少年。遺跡でオーガノイド・ジークと謎の美少女フィーネに出会い、フィーネの過去を探す旅に出る。
愛機はシールドライガー |
| フィーネ・エリシーヌ・リネ |
| 性別 |
女 |
| 身分 |
古代ゾイド人 |
| 本作のヒロインで古代ゾイド人。ジーク共に目覚めた謎の美少女であり、記憶を失くしているが不思議な力を持っている。多少、天然ボケが入っている。 |
| ジーク |
| 性別 |
？ |
| 身分 |
オーガノイド |
| バンが遺跡で見つけたオーガノイド。他のゾイドと合体することで傷を癒すことができる。背中のブースターにより高速で移動することが可能。 |
| アーバイン |
| 性別/年齢 |
男 ２２歳 |
| 身分 |
盗賊 |
最初はバンのジークを狙う盗賊だったが行動を共にしているうちに仲間になる。バンの兄貴的存在。左目を覆っている眼帯は映像を録画することもできる。
愛機はオリジナルカラーのコマンドウルフ |
| ムンベイ |
| 性別 |
女 |
| 身分 |
運び屋 |
自称 荒野の運び屋。フィーネと同じく基本的に戦闘には参加しないが、フィーネとは違い、世間の厳しさを知っているお姉さん的存在。
愛機はオリジナルカラーのグスタフ |
| ロブ・ハーマン |
| 性別 |
男 |
| 身分 |
共和国軍大尉 |
共和国軍の指揮を執る軍人。頑固で勝気な性格だが部下からの信頼は厚い。実はある人の息子。
飛行ゾイドには乗らないほうがいいかも |
| カール・リヒテン・シュバルツ |
| 性別 |
男 |
| 身分 |
帝国軍少佐 |
帝国軍屈指の優秀な指揮官。プロイツェン派との対立に遭いながらも自分の信念は決して捨てないプライドを持っている。
愛機は主にセイバータイガーとアイアンコング |
| レイヴン |
| 性別 |
男 |
| 身分 |
帝国所属のゾイド乗り |
帝国が誇る最強のゾイド乗り。ゾイドの操縦にかけては天才的かつ圧倒的な実力を誇る。バンと同じくオーガノイド・シャドーを連れている。
愛機はセイバータイガー |
| ギュンター・プロイツェン |
| 性別 |
男 |
| 身分 |
帝国の摂政 |
| 帝国の皇帝の座を狙っている。そのためならどんな手段も選ばない卑劣な男。果たしてプロイツェンの研究所で開発されているものはいったい？ |
